חוק הפולחן של 1937 דורש שקבוצות דתיות באקוודור יירשמו במשרד הפנים. כדי להירשם, ארגון דתי חייב להחזיק ברשותו זיכיון; להיות בעל מעמד של ללא כוונת רווח; לכלול בבקשתו את כל השמות הנמצאים בשימוש על-ידי הקבוצה, כדי לוודא שלא משתמשים בשמות של קבוצות אחרות שנרשמו בעבר ללא רשותן ; ולספק חתימות של לפחות חמישה-עשר חברים, בדרך כלל המנהיגים של הארגון.
ב-13 בפברואר 1991, המעמד של ארגון הסיינטולוגיה של אקוודור, שהוקם תחת חוק הקבוצות הדתיות, נרשם ופורסם במשרד הרישום הרשמי.
״שהיעדים והמטרות של ארגון הסיינטולוגיה של אקוודור הן ... פילוסופיה דתית במובן המלא שמקדמת את האדם לעבר חופש ואמת מוחלטת.״